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成份不一样
低聚果糖又被称为寡葡萄糖或蔗糖三糖族低聚木糖，是以蔗糖为原材料，由1～3个葡萄糖基根据β(2—1)糖苷键与蔗糖中的葡萄糖基融合转化成的蔗果三糖、蔗果四糖和蔗果五糖等的化合物。
低聚半乳糖是乳糖作原材料，在浓度较高的下要酵母菌或黄曲霉菌的β -半乳糖苷酶即乳糖酶的催化反应而转化成的低聚木糖，其主要成分为一种三糖 6-半乳糖基乳糖，β -半乳糖苷酶可催化反应乳糖之水解反应，在浓度较高的底物存有下也催化反应乳糖的迁移反映，迁移反映的物质是双糖(半乳糖基半乳糖)，三糖和分子结构再大一些的低聚木糖。
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口味不一样
低聚果糖是一种纯天然活性物质。糖度为蔗糖的0.3-0.6倍。既维持了蔗糖的正宗清甜味特性，又比蔗糖清甜味清新。
低聚半乳糖其糖度为蔗糖的 20%- 40%，耐热性优良，在酸碱性下很平稳，黏度贴近蔗糖，有不错的保湿补水性，食品产业将它很多用以婴儿奶粉中，还边加个奶制品，冷食、糖块、营养成分原浆、油类中。
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作用不一样
低聚果糖，最引人注意的生理学特点是它能大大提高肠胃内微生物菌种物种占比，它是肠内双岐杆菌的活性繁衍因素，可降低和抑止肠内腐坏化学物质的造成，抑止危害病菌的生长发育，调整肠胃内均衡;能推动营养元素铁、钙的消化吸收与运用，以避免骨质疏松;可降低肝毒，能在肠中转化成防癌的有机物，有明显的抗癌作用。
低聚半乳糖是人体肠道中双岐杆菌、嗜酸乳杆菌等肠道益生菌很好的营养成分源和合理的繁衍因素，能够改进人体肠道的消化作用。新生婴儿的消化吸收作用较为欠缺，因此婴儿奶粉上都加上了低聚半乳糖的营养元素。
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